LATA 1716-1788
1716-1722 o. Maksymilian Wężyk SI
1722-1724 o. Kazimierz Czyrzewski SI
1724-1725 o. Stanisław Kazanowski SI
1725-1730 o. Piotr Żeleźnicki SI
1730-1736 o. Jan Cywiński SI
1736-1738 o. Ignacy Moszyński SI
1738-1742 o. Krystian Iwański SI
1742-1745 o. Jan Ruciński SI
1745-1747 o. Jędrzej Mączyński SI
1747-1732 o. Antoni Ostrowiecki SI
1732-1756 o. Krystian Łabęcki SI
1756-1760 o. Jan Lokański SI
1760-1764 o. Ludwik Skrzyński SI
1764-1765 o. Aleksander Żychliński SI
1765–1771 o. Gabriel Jedel SI
1771-1788 o. Karol Berent SI
LATA 1788-1865
Od 1788 r. do 1865 rektorami byli księża pijarzy, między innymi:
1829 o. Szelewski SP
1846 o. Kiełbikowski Jacek SP; o. Gajewski Józef SP
1865 o. Tęczyński Marcin SP; o. Kabowski SP
LATA 1865-1918
Od roku 1865 do roku 1918 rektorami byli księża diecezjalni:
1865-1870 ks. Gajewski Józef
1870-1894 ks. Sałaciński Aleksander
1894-1918 ks. Cwilong Zenon
LATA 1865-1918
W latach 1918-1927 rektorami kościoła byli ponownie Jezuici:
1918-1920 o. Stanisław Lic SJ
1920-1923 o. Julian Smodlibowski SJ
1923-1926 o. Antoni Czenczek SJ
1926-1927 o. Józef Mieloch SJ
1927 o. Andrzej Czarnota SJ
LATA 1927-1945
W latach 1927-1945 rektorami byli księża diecezjalni:
1927-1928 ks. Wiktor Potrzebski
1928-1932 ks. Józef Goździk
1932-1937 ks. Franciszek Jeliński
1937-1945 ks. Henryk Rogowski
OD ROKU 1945
Po zakończeniu II wojny światowej kościół przechodzi pod opiekę Jezuitów:
1945-1946 o. Stanisław Urban SJ
1946-1947 o. Leon Nowak SJ
1947-1949 o. Wacław Sęk SJ
1949-1953 o. Franciszek Ksawery Wicha SJ
1953-1954 o. Czesław Domaradzki SJ
1954-1956 o. Donat Stawski SJ
1956-1962 o. Wincenty Orsaczek SJ
1962-1967 o. Tadeusz Andersohn SJ
1967-1974 o. Edward Czermiński SJ
1974 o. Władysław Janczak SJ (vicesup.)
1974-1981 o. Józef Wlazło
1981-1984 o. Andrzej Polasik SJ
1984-1990 o. Remigiusz Wysocki SJ
1990-1994 o. Zygmunt Kurowski SJ
1994-1998 o. Jan Orłowski SJ
1998-2002 o. Edmund Lenz SJ
2002-2008 o. Andrzej Lemiesz SJ (od roku 2006 rektor kościoła jest Kustoszem Sanktuarium)
2008-2011 o. Zdzisław Jaśko SJ
2011-2012 o. Tadeusz Domeracki SJ
2012-2018 o. Mieczysław Jóźwiak SJ
2018-2022 o. Adam Sołdek SJ
od 2022 o. Grzegorz Ginter SJ